為確保幼兒可以在優質且安全的教學環境接受教保服務，國教署除辦理幼兒園專業發展輔導外，並依幼兒教育及照顧法第46條規定，要求直轄市、縣(市)主管機關應落實對教保服務機構辦理檢查輔導，及辦理幼兒園基礎評鑑。為加強檢查效能，教育部國教署除規範各縣市每年應稽查園數外，並請各縣市應跨單位辦理聯合稽查每年至少4場以上，並採不定期及不預警稽查方式辦理。
國教署說明，目前全國22縣市皆已建立聯合稽查機制，並就稽查項目、稽查頻率、參與人員等，訂定相關稽查機制，各直轄市、縣（市）政府採定期及不定期方式，邀集衛生局、建築管理處、消防局、監理所等單位，就幼兒園管理、園舍環境衛生安全、消防設施設備、幼童車等項目進行稽查，轄內聯合稽查的違規情形，除依規定裁處罰鍰外，亦督導幼兒園限期改善。此外，國教署也於113年度配合教育部終身教育司辦理的「113年度直轄市、縣（市）政府短期補習班公共安全管理訪視實施計畫」，共同進行聯合稽查部分幼兒園，以強化幼兒安全及權益。同時為增進稽查人員之專業知能，各直轄市、縣（市）政府自113年度起每年度針對稽查人力應定期辦理至少2次的實體增能研習培訓。
為落實督導聯合稽查，提升稽查效能，有關稽查人員研習辦理情形、裁罰公告登載時效、申訴案件回報處理情形列為113年度中央對直轄市及縣市政府一般教育補助考核評分項目。國教署表示，為確保教保品質，每年均請直轄市及縣市政府教育局處應落實對幼兒園的管理與查察，倘有違規行為，應輔導及追蹤幼兒園改善情形，以維護幼兒就學權益。
