本次紀念活動分為兩大部分，除了紀念音樂會外，於白天另有事故現場隧道紀念燈光啟動點燈。當第408次3000型新自強號列車行經北迴線和仁站時，車廂內播放由家屬預錄的廣播，回顧當年接獲噩耗的瞬間，以及5年來將悲痛轉化為勇氣的心路歷程，並分享參與推動隧道紀念燈光建置的心情故事及和仁、清水及崇德三座隧道燈光分別代表的意涵。
隧道紀念燈光工程自111年11月2日召開「0402K51事故現場隧道內增設紀念燈光事宜研討」會議並成立推動小組起，歷經兩年多規劃、測試與調整，終於在114年4月2日正式點燈啟用。該組紀念燈光設計命名為「9點28分AM永恆的愛與思念」，其中，和仁隧道以9盞琥珀光及28盞白光象徵事故發生時間9點28分，提醒我們不要遺忘；清水隧道以連續的白色光帶，引導人們進入一段靜止而安靜的時間,象徵永恆、愛與思念；崇德隧道則以28盞白光與9盞琥珀光，如同時間倒轉，寄託著人們希望回到事故發生前的日常，以祈願憾事不再發生。該作品已榮獲德國紅點設計獎、德國IF設計獎、美國繆斯設計獎金獎及瑞士LIT照明設計獎等多項國際肯定。
此外，臺鐵公司亦通令於4月2日上午9時28分，全線各級列車同步鳴笛，以表達對罹難者的追思與致意。
晚間舉行的紀念音樂會，活動內容包含隧道紀念燈光介紹、播放家屬提供的紀念影片、家屬感言分享，以及多段音樂演出。現場設置追思區，以潔白色系搭配滿天星、繡球花，營造溫馨典雅的氛圍；並以書信為寓意，由家屬寫下對親友的話語與思念，藉此傳遞對親人的祝福與想念之意，將愛與記憶化為永恆。
音樂會由「人聲樂團—果子好聲音」揭開序幕，接續由嘉頌銅管重奏團及男高音孔孝誠演出，以音樂堆疊情感、撫慰人心；隨後由排灣族原住民青少年團體演出，以承諾堅守安全，擁抱信念與強化勇氣，祝福未來希望前行。最後，全場在司儀引導下共同點亮電子蠟燭並齊唱歌曲，象徵光明、希望與愛，將追憶化為前行的力量。
配合紀念活動，高雄車站下沉式廣場（B1）自3月26日至4月8日設置鐵路安全宣導展示區，透過時間軸方式，呈現事故後至今，家屬與各界推動鐵路安全所做的努力與重要事件，將悲慟轉化為具教育意義的正向力量，深化社會大眾對鐵路安全的重視。
另為向下扎根安全教育，高雄站同步辦理「小小代言人」活動。臺鐵公司表示，今年首度開放線上報名即在1天內迅速額滿，顯示民眾對鐵路安全議題的高度關注。本次活動藉由車站設備介紹與知識宣導，讓孩童及民眾親身參與，期盼擴大社會影響力，建立全民重視鐵路安全的共識。
